System Maconomy jest zaprojektowany jako całościowe, w pełni zintegrowane rozwiązanie. Pozwala to na eliminację problemów związanych z zachowaniem integralności danych w ramach poszczególnych modułów systemu, uniknięcie zagrożenia wystąpienia niespójności danych, które pojawia się w przypadku wykonywania modyfikacji działającego już systemu, znaczącej rozbudowy czy konwersji.
Architektura serwera Maconomy składa się z trzech warstw: warstwy prezentacji (klient Maconomy dostępny na wielu platformach), warstwa aplikacji (logika operacji biznesowych) i warstwa technologii. Ostre rozgraniczenie pomiędzy poszczególnymi warstwami zapewnia dużą skalowalność systemu i możliwość zastosowania wielu interfejsów użytkownika, systemów operacyjnych serwera, systemów bazy danych oraz interfejsów zapewniających integrację.
Warstwa technologii integruje i zapewnia niezawodne działanie w dowolnym miejscu aplikacji dla następujących funkcji:
- Elastyczna kontrola dostępu
- Wiele opcji integracji
- Dynamiczne narzędzia do tłumaczenia obsługujące wiele języków
- Zintegrowana architektura do tworzenia raportów
- Łatwość przeniesienia system na inną platformę
- Nieduże wymagania sprzętowe, bardzo dobry współczynnik wydajność system/cena
- Wspomaganie procesów biznesowych dzięki wbudowanym narzędziom